1871年，摩根的合伙人查尔斯·达布尼退休，他们之间的合作关系也随之解除。在父亲的撮合下，摩根与德雷克赛尔家族合作，合伙开办了德雷克赛尔-摩根公司，即J.P.摩根公司的前身。
德雷克塞尔-摩根合并后不久发生的一件大事，使得年仅36岁的摩根一跃跻身于美国金融界的最高层。1873年，库克、华尔街的塞利格曼财团以及欧洲的罗斯柴尔德财团联手，以获取3亿美元的偿债融资债券的发行，对抗来自德雷克塞尔-摩根公司、J.S.摩根公司、莫顿-布利斯公司和巴林兄弟公司的强大挑战。在这个极度激烈的市场，摩根财团一跃占据了联邦融资中的主导地位。在这次，摩根赚了100多万美元，他向父亲自夸说：“我相信这个国家再没有其他事情能带来这样的结果了。”
随着战争的推进，美国联邦政府出现了严重的财政危机。联邦政府为了稳定日趋恶化的经济和支付购买武器的费用，决定发行4亿美元的公债。摩根用敏锐的嗅觉再一次预感到这是一个发财的机会，于是信心十足的摩根答应承担2亿美元国债的发行。